Expulsos os jesuítas das missões orientais, a elas retornaram em 1639. Nessa segunda fase de atividades, fundam o povo de São Francisco de Borja, daí o nome que, abrigando a população indígena das regiões situadas entre o Icamaquã e o Butuí, bem como a da margem Argentina, chegou a possuir quase 4000 habitantes. Nessa época, foi designado um Comandante Geral das Missões, função que deveria ser exe...